Το Δευτερεύον Πρόγραμμα στη Βιοϊατρική Μηχανική (ΒΜ) είναι ανοικτό σε όλους τους φοιτητές του Πανεπιστημίου. Αποτελείται από 10 μαθήματα με συνολικό φόρτο εργασίας τουλάχιστον 60 πιστωτικών μονάδων. Λόγω ανομοιομορφίας στον αριθμό των πιστωτικών μονάδωνμεταξύ συμμετεχόντων τμημάτων σε ειδικές περιπτώσεις θα γίνεται εξαίρεση για 10 μαθήματα του προγράμματος που συγκεντρώνουν 57 και άνω πιστωτικών μονάδων.. Οι φοιτητές οφείλουν να συμπληρώσουν το δευτερεύον πτυχίο μέσα στα 8-12 εξάμηνα τα οποία παρέχονται για τη συμπλήρωση ενός κανονικού πτυχίου. Η επιλογή των μαθημάτων μπορεί να γίνει μεταξύ των προσφερόμενων μαθημάτων σε Χειμερινό και Εαρινό εξάμηνο:
Χειμερινό Εξάμηνο
BIO 102 Αρχές Βιολογίας
ΒΙΟ 230 Εισαγωγή στην Υπολογιστική Βιολογια
ΒΙΟ 4423 Πρακτική Άσκηση στη Βιολογία
ΒΙΟ 495, 496, 497, 498, 499 Σύγχρονα Θέματα Βιολογίας
ΒΙΟ 491/492 Σύγχρονα Θέματα Βιολογίας
(HMY 623)
ΕΠΛ 428 Διαδίκτυο των Πραγμάτων: Προγραμματισμός και Εφαρμογές
ΕΠΛ 434 Λογικός Προγραμματισμός και Τεχνητή Νοημοσύνη
ΕΠΛ 435 Αλληλεπίδραση Ανθρώπου-Υπολογιστή
ΕΠΛ 442 Υπολογιστική Όραση
ΕΠΛ 445 Ψηφιακή Επεξεργασία Εικόνας
ΗΜΥ 421 Ευφυή Συστήματα (ή ΗΜΥ 634)
ΗΜΥ 429 Εισαγωγή στην Επεξεργασία Ψηφιακών Σημάτων (ή ΗΜΥ 623)
ΗΜΥ 434 Εισαγωγή στην Φωτονική
ΗΜΥ 473 Αισθητήρες & Συστήματα Οργάνων (ή ΗΜΥ665)
ΗΜΥ 476 Βιοϊατρική Απεικόνιση (ή ΗΜΥ 6xx)
ΜΜΚ 420 Ρομποτική
MMK 435 Εισαγωγή στην Βιολογική και Βιοϊατρική Μηχανική
ΒΜΤ ΧΧΧ Επιβλεπόμενη Μελέτη Βιοϊατρικής Μηχανικής
ΒΜΤ ΧΧΧ Εξειδικευμένα Θέματα Μηχανικής Βιοϊατρικής Τεχνολογίας
Εαρινό Εξάμηνο
ΒΜ ΧΧΧ Επιβλεπόμενη Μελέτη Βιοϊατρικής Μηχανικής
ΒΜ ΧΧΧ Εξειδικευμένα Θέματα Μηχανικής Βιοϊατρικής Τεχνολογίας
Οι φοιτητές μπορούν να εγγραφούν σε μέχρι και 2 από τα παρακάτω μεταπτυχιακά μαθήματα:
BIO 630 Νουκλεϊνικά Οξέα
BIO 650 Ειδικά Θέματα Βιοπληροφορικής
BIO 670 Οπτική Απεικόνιση στη Βιολογία
ΕΠΛ 667 Νευροπληροφορική
ΕΠΛ 668 Υπολογιστική Όραση (παρόμοιο με HMY 627)
ΕΠΛ 679 Ηλεκτρονική Υγεία
ΕΠΛ 680 Γνωστικός Προγραμματισμός
ΗΜΥ 623 Εισαγωγή στην Επεξεργασία Ψηφιακών Σημάτων
ΗΜΥ 626 Ψηφιακή Επεξεργασία Εικόνας
ΗΜΥ 627 Μηχανική Όραση (παρόμοιο με ΕΠΛ 668)
ΗΜΥ 634 Ευφυή Συστήματα
ΗΜΥ 645 Εισαγωγή στην Φωτονική
ΗΜΥ 665 Αισθητήρες & Συστήματα Οργάνων
ΗΜΥ 671 Νευροφυσιολογία και Αισθήσεις
ΗΜΥ 6xx Βιοϊατρική Απεικόνιση
MMΚ 555 Polymers in Medical Applications
ΜΜΚ 531 Μηχανική Συνεχών Μέσων
ΜΜΚ 532 Βιοϋλικά στη Μηχανική Ιστών και την Αναγεννητική Ιατρική
Για απόκτηση δευτερεύοντος πτυχίου οι φοιτητές πρέπει να συμπληρώσουν τουλάχιστον 5 επιπρόσθετα μαθήματα που δεν έχουν προσμετρηθεί στην απόκτηση του κυρίως πτυχίου τους. Ένα από τα επιλεγόμενα μαθήματα του Δευτερεύοντος Προγράμματος στη Βιοϊατρική Μηχανική μπορεί να είναι ένα από τα μαθήματα «Επιβλεπόμενη Μελέτη Βιοϊατρικής Μηχανικής» ή «Εξειδικευμένα Θέματα Μηχανικής Βιοϊατρικής Τεχνολογίας».